Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp7P70280 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vamp7P70280 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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