Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NficP70255 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NficP70255 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms