Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab8bP61028 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms