Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csrnp3P59055 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csrnp3P59055 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms