Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms