Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms