Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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P58686 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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P58686 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P58686 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms