Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms