Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms