Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms