Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map3k1P53349 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms