Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms