Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brca1P48754 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms