Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VhlP40338 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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