Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtlP38585 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms