Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HmgclP38060 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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