Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms