Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms