Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms