Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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