Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms