Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms