Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms