Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CftrP26361 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CftrP26361 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms