Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms