Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms