Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc1P19123 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnnc1P19123 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms