Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18528 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18528 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms