Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpraP18052 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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