Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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