Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb2P13373 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms