Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lire1P11260 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lire1P11260 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms