Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TtrP07309 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TtrP07309 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TtrP07309 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms