Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnfP06804 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnfP06804 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TnfP06804 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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