Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PdgfrbP05622 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PdgfrbP05622 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfrbP05622 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PdgfrbP05622 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PdgfrbP05622 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PdgfrbP05622 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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