Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P03980 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P03980 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P03980 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P03980 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P03980 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P03980 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P03980 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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