Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01823 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01823 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01823 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01823 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01823 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01823 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms