Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AurkcO88445 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms