Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clec11aO88200 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms