Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxq1O70220 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms