Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stag2O35638 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms