Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NmiO35309 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NmiO35309 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NmiO35309 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NmiO35309 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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NmiO35309 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NmiO35309 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NmiO35309 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms