Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f3O35261 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms