Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smad6O35182 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smad6O35182 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms