Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casq1O09165 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Casq1O09165 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casq1O09165 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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