Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EllO08856 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EllO08856 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EllO08856 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EllO08856 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EllO08856 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EllO08856 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EllO08856 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms