Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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