Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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