Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tcrg-C3L7N479 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms