Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC117090L7N257 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms